مطالعه ارتباط کمی ساختار - فعالیت و نحوه اتصال در بازدارنده های آنزیم تیروزیناز

ارتباط کمی ساختار- فعالیت (qsar) و نحوه اتصال برخی از بازدارنده های جدید آنزیم تیروزیناز قارچ با استفاده از روشهای qsar وdocking مورد بررسی قرار گرفت. ساختار مولکولهای مورد نظر با روشهای +mm وam1 در فازهای گاز و محلول با استفاده از نرم افزار hyperchem رسم و بهینه سازی شد. حدود1500 توصیف کننده توسط نرم افزار dragon محاسبه و خروجی های آن وارد spss شد و ارتباط بین پارامتر زیستیlog ic50 و این توصیف کننده ها به کمک روش رگرسیون خطی چندگانه (mlr)، آنالیز مولفه اصلی (pca) و رگرسیون مولفه اصلی (pcr) به دست آمد. نتایج نشان داد ارتباط خوبی بین مقادیر تجربی log ic50 و مقادیر پیش بینی شده وجود دارد. همچنین نتایج نشان داد که با کاهش بار، مساحت سطح قطبی و درجه تا شدگی و افزایش انرژی آبپوشی، log ic50 افزایش می یابد. از سوی دیگر، نتایج محاسبات در فاز گاز و محلول نشان داد که ضریب همبستگی فاز محلول بیشتر است. هم چنین دسته بندی ترکیبات با استفاده از pca انجام شد و 6 دسته مختلف به دست آمد. ساختار سوم آنزیم تیروزیناز توسط روش هومولوژی مدلینگ با استفاده از نرم افزار modeller و دینامیک مولکولی gromacs به دست آمد. سپس انرژی اتصال و جایگاه اتصال لیگاند ها به آنزیم توسط نرم افزار auto dock انجام شد. اتصال در کل آنزیم و جایگاه فعال صورت پذیرفت. در کل ارتباط مستقیمی بین log ic50 و انرژی اتصال به دست آمد، که نتایج اتصال به جایگاه فعال بهتر از کل پروتئین بود. فعالیت ترکیبات دارای log ic50 کمتر، انرژی اتصال منفی تر و پیوند هیدروژنی بیشتر بودند. هم چنین در ترکیبات با فعالیت بیشتر، قسمت های آبگریز ترکیب با قسمت های آبگریز و قسمت های آبدوست ترکیب با قسمت های آبدوست پروتئین بر هم کنش داشتند. در حالیکه این مشاهدات برای ترکیبات کم فعال کمتر مشاهده شد.